清水祖师庙位于三峡镇中心，创建于清干隆34年，在道光13年时因地震损毁而重建。到1895年时又惨遭日军焚毁，四年后在地方士绅筹画下二度重建。第三次则在台湾光复后，由艺术家李梅树先生主导设计规划，他主张祖师庙该成为一座融合中国历史、文化和寺庙艺术的庙宇，同时因其本身的西画素养，使祖师庙又加入了西洋美术的色彩。此次工程自民国36年开始，至今仍在进行中。

    庙内供奉清水祖师，平日香火鼎盛，与万华龙山寺、大龙峒保安宫并称北市三大寺庙。祖师庙的精致讲究的雕工，闻名全台，因而得“东方艺术殿堂"之美名，已成为全台湾庙宇建筑的经典之作。